Анализ полногеномных данных, собранных на платформе GWAS-MAP|ovis, позволивший выявить у овец гены, связанные с признаками мясной продуктивности, провели ученые Курчатовского геномного центра ФИЦ «Институт цитологии и генетики (ИциГ) СО РАН», 5 апреля сообщает издание СО РАН «Наука в Сибири» со ссылкой на пресс-службу ИЦиГ.

Ученые центра исследуют возможности генетического контроля мясной продуктивности овец методами количественной генетики. Для этих целей ими была создана платформа GWAS-MAP|ovis, которая агрегирует, унифицирует и визуализирует результаты полногеномных исследований овец.

Анализ данных о геномах разных пород, собранных исследователями на платформе, позволил с ее помощью провести анализ этих данных. В результате учеными ИциГ СО РАН были найдены 12 локусов (местоположение определенного гена на генетической карте хромосомы), связанных с мясной продуктивностью. При этом восемь из них были выявлены впервые.

Данные о генах, связанных с конкретными признаками животных, могут быть использованы в дальнейшем для селекции или редактирования генома.

Младший научный сотрудник ИЦиГ СО РАН Александр Злобин пояснил задачу исследователей:

«Овцеводство — одна из важнейших отраслей сельского хозяйства. В настоящее время самым популярным продуктом овцеводства является именно мясо, хотя до недавнего времени, в селекции овец больше внимания уделялось признакам, связанным с качеством шерсти. В отличие от крупного рогатого скота, сведений о локусах и генах овец, ассоциированных с различными экономически важными признаками, известно существенно меньше».

При поиске данных для платформы исследователи выяснили, что в подавляющем большинстве научных статей доступ к полногеномным данным отсутствовал. Так, лишь одно исследование из 46 позволило получить такие данные в нужном формате.

«Также одной из проблем было отсутствие общепринятых стандартов для проведения полногеномных исследований ассоциаций овец, каждый исследователь выбирал свои собственные стандарты и ограничения», — рассказал Александр Злобин.

Тем не менее исследователи сумели наполнить платформу GWAS-MAP|ovi унифицированными данными, что и позволило выявить новые локусы с 13 генами, связанными с мясной продуктивностью овец.

С помощью созданной ими платформы ученые ИЦиГ СО РАН провели оценку племенной ценности российских пород овец и сопоставили результаты с реальными данными о 94 животных, гибридах романовской породы овец и архара, полученными из Федерального исследовательского центра животноводства — ВИЖ им. академика Л. К. Эрнста.

Результаты исследования подтвердили высокий потенциал созданной платформы для предсказания селекционной ценности конкретных пород.