Подвидовую изменчивость и этапы адаптации растения Ilex polyneura, широко распространенного диплоидного представителя лиственной восточноазиатской ветви, исследовали ученые из Тропического ботанического сада Сишуанбаньна (XTBG) Китайской Академии наук, 19 января сообщает Phys.org.

Илекс (Aquifoliaceae) остролистный, является одним из крупнейших и наиболее характерных древесных двудомных родов в тропическом и субтропическом юго-западном Китае.

Многие виды этого растения повсеместно используются для приготовления напитков, лекарств, красителей, в декоративных целях и в качестве медоноса. Подвидовые растения использовались в садоводстве для выведения новых сортов и гибридов.

Ученые провели популяционное геномное исследование 112 растений, собранных из 21 популяции во всем диапазоне высот, с использованием секвенирования ДНК.

Собранный геном составлял приблизительно 727,1 Мбайта. Анализ BUSCO позволил получить 97,6 процента универсальных ортологов в одной копии, что указывает на высокую непрерывность и полноту сборки, а 98,9 процента сборки генома было закреплено на 20 псевдохромосомах.

«Это первый расшифрованный геном в хромосомном масштабе в огромном роде Ilex, а также в отряде Aquifoliales. Это также единственный геном, доступный для древесного представителя зонтикоцветных», — сказал Яо Синь из XTBG.

Популяционно-генетический анализ выявил свидетельства дивергентного отбора, ведущего к геномной адаптации Ilex polyneura к различным высотам. Виды, растущие на низких и высоких высотах имеют более простые генетические структуры, в то время как растения, произрастающие на средних высотах имеют смешанное происхождение -как с представителями малых, так и больших высот.