Новый перспективный фармакофор, который может стать основой для противоопухолевых, противовирусных, антибактериальных и антипротозойных препаратов, выявили ученые Новосибирского государственного университета (НГУ) совместно с исследователями из МГУ им. М. В. Ломоносова и НИУ ВШЭ, 2 февраля сообщает пресс-служба НГУ,

Белок урацил-ДНК-гликозилаза (UNG) в норме отвечает за восстановление (репарацию) ДНК, защищая геном человека и других организмов от повреждений. Превращение нормального звена ДНК, цитозина, под действием воды в урацил может приводить к мутациям и гибели клетки, UNG отслеживает и исправляет такие повреждения.

Однако в раковых клетках такая репарация ДНК раковых клеток мешает действию химиотерапии, а UNG опасных бактерий и вирусов в зараженном организме повышает их вирулентность. Таким образом, для успешного лечения в некоторых случаях необходимо подавлять урацил-ДНК-гликозилазу.

В статье, посвященной результатам исследования, опубликованной в журнале Molecules, исследователи сообщают, что большинство ингибиторов UNG, разработанных в настоящее время, основаны на урациловом основании, связанном с различными заместителями, однако требуются новые фармакофоры, нацеленные на широкий спектр UNG.

В поисках таких фармакофоров ученые проанализировали библиотеку из 1 027 767 лигандов — молекул, связанных с белком и определяющих его функционирование, в поисках таких, которые подавляют действие UNG человека и вируса коровьей оспы (переносится от коров к человеку) и обнаружили новый перспективный фармакофор.

Для оценки экспериментальной активности из выбранных в начале 378 потенциально активных лигандов для экспериментов были выбраны 19, а четыре потенциально неактивных лиганда были включены в качестве контроля.

Доктор биологических наук, член-корреспондент РАН, профессор факультета естественных наук НГУ Дмитрий Жарков рассказал о полученных результатах исследования:

«В ходе экспериментов мы выявили, что соединения, которые с разной степенью эффективности подавляют фермент UNG, обладают общим фрагментом — тетрагидро-2,4,6-триоксопиримидинилиденом. В фармакологии подобные фрагменты, отвечающие за активность лекарства, называются фармакофорами. Наш активный фрагмент оказался новым и уникальным».

Уникальность этого фармакофора заключается в его отличной от применяющихся в настоящее время ингибиторах UNG пространственной структуре.

Ученый пояснил, что, «взяв этот фармакофор за основу, можно заниматься дальнейшими исследованиями по созданию препаратов и улучшению их характеристик (активности, усвоению организмом и т. д.)».