Ученые создали систему автоматического анализа биомедицинских видеоданных

Систему, основанную на методах компьютерного зрения, которая позволяет автоматически анализировать биомедицинские видеоролики, снятые с помощью микроскопии, разработали исследователи из Мадридского университета Карлоса III (UC3M), 11 февраля сообщает Phys.org.
Эти новые методы, разработанные командой инженеров UC3M, использовались для диагностики в живых тканях. В результате было обнаружено, что нейтрофилы (тип иммунных клеток) проявляют различное поведение в крови во время воспалительных процессов. А один из них, вызванный молекулой Fgr, связан с развитием сердечно-сосудистых заболеваний.
«Наш вклад состоит в проектировании и разработке полностью автоматической системы, основанной на методах компьютерного зрения, которая позволяет нам характеризовать исследуемые клетки путем анализа видеозаписей, снятых биологами с использованием микроскопа», — говорит профессор Фернандо Диас де Мария, руководитель группы обработки мультимедиа UC3M.
В эксперименте были проведены автоматические измерения формы, размера, параметров движения и положения относительно кровеносного сосуда нескольких тысяч клеток. Для сравнения, традиционные биологические исследования обычно подкрепляются анализом нескольких сотен проанализированных вручную клеток. Таким образом, стало возможным провести более детальный биологический анализ с большей статистической значимостью.
По мнению исследователей, эта новая система обладает рядом преимуществ с точки зрения времени и точности.
«Нецелесообразно заставлять эксперта-биолога сегментировать и отслеживать клетки на видео в течение нескольких месяцев. С другой стороны, чтобы дать приблизительное представление (поскольку это зависит от количества ячеек и глубины 3D-объема), нашей системе требуется всего 15 минут для анализа 5-минутного видео», — говорит Иван Гонсалес Диас, доцент кафедры теории сигналов и коммуникаций UC3M.