Биоинформатики Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ получили грант на развитие своих программ работы с генами SPAdes и QUAST. Грантодателем стал Фонд «Инициатива Чан — Цукерберга», сообщает 31 августа пресс-служба СПбГУ.

Согласно сообщению, Центр алгоритмической биотехнологии СПбГУ занимается решением важнейших вычислительных задач современной биомедицины.

Флагманский продукт центра — программа SPAdes (Saint Petersburg Assembler). Она восстанавливает полную первичную структуру геномной ДНК, то есть фактически расшифровывает генетический код. В свою очередь, программа QUAST (Quality Assessment Tool) определяет качество геномных сборок, а также может их сравнивать.

Данные две программы связаны логикой геномного проекта: оценка качества данных — сборка данных — оценка качества сборки — научный анализ.

«Это уникальный грант, аналогов которому нет. Он является признанием значимости для мировой науки пакета программ, созданных нашей лабораторией. Мало кто создает некоммерческие программы такого уровня и качества», — рассказала заместитель директора центра Алла Лапидус.

Она отметила, что в России это единственный бренд с десятками тысяч пользователей по всему миру и признанием лидерства обоих продуктов «самыми строгими и придирчивыми экспертами».

Обе программы являются программными продуктами с открытым исходным кодом. Грант, полученный учеными СПбГУ, направлен на поддержку программ с открытым исходным кодом, необходимых для биомедицинских исследований.