Органическое соединение, способное связывать ряд белков SARS-CoV-2, выявила группа исследователей из российских университетов, сообщила 21 сентября пресс-служба Уральского федерального университета (УрФУ).

Используя метод молекулярного докинга (метод предсказывает предпочтительную ориентацию одной молекулы ко второй при связывании друг с другом с образованием стабильного комплекса), коллектив ученых установил, что органическое соединение сален эффективно связывает ряд белков коронавируса SARS-CoV-2.

Наибольшую активность сален проявляет по отношению к неструктурному белку nsp14, препятствующему разрушению вируса. Ученые считают, что полученные в результате их исследований данные будут полезны при разработке новых препаратов и эффективных методов лечения COVID-19.

Результаты исследования ученые представили в статье «Сален: понимание кристаллической структуры, анализ поверхности по Хиршфельду, оптические свойства, DFT и исследования молекулярной стыковки», опубликованной в журнале Polycyclic Aromatic Compounds.

Инженер-исследователь лаборатории органического синтеза УрФУ Дамир Сафин рассказал: «В фокусе нашего исследования было широко известное соединение — сален. Мы попытались с „предсказательной“ точки зрения оценить потенциальную активность данного соединения по отношению к серии белков вируса SARS-CoV-2, который является причиной заболевания COVID-19».

В результате проведенных исследований была установлена активность салена в отношении неструктурного белка nsp14, защищающего вирус от разрушения.

Сален — органическое соединение, его получают из салицилового альдегида и этилендиамина, он является одним из наиболее известных представителей оснований Шиффа. Соединения такого типа могут стабилизировать разные металлы в их различных степенях окисления, что имеет особый практический интерес. Металлокомплексные соединения саленовых производных активно используются также в качестве катализаторов.

В своем составе сален содержит в гидроксильных группах два «подвижных» атома водорода, каждый из которых может перемещаться к атомам азота, образуя различные формы молекулы в процессе, получившем название таутомеризация, а его участники называются таутомерами или таутомерными формами.

«Нам было интересно изучить потенциальное взаимодействие различных таутомеров салена с белками SARS-CoV-2 с целью выявления наиболее предпочтительной таутомерной формы исследуемой молекулы с точки зрения эффективности взаимодействия с белками. Безусловно, проведенные нами исследования являются всего лишь первым шагом на пути понимания того, как сален может быть использован в борьбе с COVID-19, многое еще предстоит изучить. Однако полученные нами результаты внушают определенный оптимизм», — заявил Дамир Сафин.

Исследование проводилось учеными научно-образовательного и инновационного центра химико-фармацевтических технологий УрФУ совместно с Курганским государственным университетом и Тюменским государственным университетом.