Новый способ определения молекулы GD2 (ганглиозида), которую производят раковые клетки, разработали биоинформатики из МФТИ и их коллеги, 25 июня сообщается на сайте МФТИ.

Здоровые клетки производят GD2 в ограниченном количестве, в отличие от раковых клеток, которые производят молекулы GD2 в больших количествах. Поэтому лечение некоторых видов рака основано на применении направленной иммунотерапии, когда мишенью для терапии служит именно GD2.

Эффективность такой терапии определяется содержанием GD2 в раковых клетках. И перед учеными стояла задача найти более надежные способы распознавания в клетках опухоли молекул GD2 для выбора метода лечения GD2-специфичными антителами.

«Стоимость курса лечения GD2-специфичными антителами может составлять сотни тысяч долларов, а помогает оно при нейробластоме где-то в четверти случаев, причем часто имеет очень сильные побочные эффекты», — пояснил руководитель исследования и заведующий лабораторией трансляционной геномной биоинформатики МФТИ Антон Буздин.

«Получается, что для большинства пациентов такая терапия оказывается бесполезна, даже вредна, не говоря о затратах. Чтобы избежать этого, надо внедрять новые молекулярно-диагностические подходы. В этом и заключается задача нашей лаборатории», — добавил он,

Используемый метод диагностики из-за сложности измерений при биопсии ненадежен. Биоинформатики сосредоточились на поиске маркерных генов, по уровню экспрессии которых можно с высокой вероятностью определить GD2-фенотип опухоли.

В ходе экспериментов исследователи пришли к выводу, что лучший биомаркер — пара генов ST8SIA1 и B4GALNT1. Посчитав уровень экспрессии этих генов в клетках больного, врач сможет оценить необходимость назначения больному GD2-направленной терапии.

По мнению директора Физтех-школы биологической и медицинской физики МФТИ Дениса Кузьмина, результаты работы группы ученых имеют огромное значение для решения важной задачи — повышения эффективности высокотехнологичной дорогостоящей медицинской помощи.

Над решением задачи работали сотрудники лаборатории трансляционной геномной биоинформатики МФТИ, Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, первого Московского государственного медицинского университета им. И. М. Сеченова, Института биомедицинской химии имени В. Н. Ореховича, Национального медицинского исследовательского центра детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачёва, Инновационного центра «Сколково», а также компаний «Omicsway», «Real Target» и «Oncobox».